Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM47AQ5JRC9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47AQ5JRC9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms