Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC92Q53HC0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms