Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LONRF3Q496Y0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LONRF3Q496Y0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms