Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms