Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms