Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P3H1Q32P28 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P3H1Q32P28 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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