Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.797e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.837e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.837e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.837e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.897e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.947e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.957e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-207ENST00000577410 873 ntTSL 518.52■□□□□ 0.568e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-221ENST00000583181 505 ntTSL 515.94■□□□□ 0.148e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-216ENST00000581202 1013 ntTSL 515.79■□□□□ 0.128e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-219ENST00000582585 891 ntTSL 513.61□□□□□ -0.238e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-217ENST00000581743 785 ntTSL 512.86□□□□□ -0.358e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-224ENST00000584411 525 ntTSL 412.76□□□□□ -0.378e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-218ENST00000581795 1430 ntTSL 212.72□□□□□ -0.378e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-213ENST00000579198 599 ntTSL 512.41□□□□□ -0.428e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-214ENST00000580296 733 ntTSL 312.4□□□□□ -0.428e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-223ENST00000584192 495 ntTSL 311.83□□□□□ -0.528e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-210ENST00000578082 841 ntTSL 410.92□□□□□ -0.668e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 NARF-215ENST00000580748 577 ntTSL 59.81□□□□□ -0.848e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.568e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.88e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.762e-6■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DLC1-204ENST00000503161 562 ntTSL 47.99□□□□□ -1.132e-6■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DLC1-206ENST00000509922 455 ntTSL 47.97□□□□□ -1.132e-6■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.192e-6■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-202ENST00000503605 595 ntTSL 313.18□□□□□ -0.32e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.42e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.682e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.692e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC9.42□□□□□ -0.92e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-203ENST00000504293 576 ntTSL 1 (best)7.07□□□□□ -1.282e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.482e-11■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.544e-14■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS24-207ENST00000466129 661 ntTSL 27.46□□□□□ -1.224e-14■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS24-210ENST00000478655 727 ntTSL 1 (best)4.72□□□□□ -1.654e-14■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 RPS24-205ENST00000464716 452 ntTSL 24.09□□□□□ -1.754e-14■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DKC1-206ENST00000452771 708 ntTSL 57.4□□□□□ -1.223e-8■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DKC1-205ENST00000437719 686 ntTSL 36.94□□□□□ -1.33e-8■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 DKC1-203ENST00000413910 851 ntTSL 56.5□□□□□ -1.373e-8■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 LAMA5-205ENST00000464134 637 ntTSL 210.49□□□□□ -0.732e-10■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.912e-10■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-216ENST00000488340 1598 ntTSL 218.3■□□□□ 0.522e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-213ENST00000481223 2815 ntTSL 215.5■□□□□ 0.072e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.32e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-215ENST00000482621 2059 ntTSL 213.02□□□□□ -0.332e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-218ENST00000496007 4452 ntTSL 211.22□□□□□ -0.612e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 CCNL2-209ENST00000471930 846 ntTSL 59.86□□□□□ -0.832e-15■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.111e-7■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 MDM2-229ENST00000543046 432 ntTSL 34.61□□□□□ -1.671e-7■□□□□ 8.7
SRSF7Q16629 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.771e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 310.07□□□□□ -0.81e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.371e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.671e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RPS24-213ENST00000485708 544 ntTSL 24.49□□□□□ -1.691e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-234ENST00000492871 1065 ntTSL 320.33■□□□□ 0.853e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-215ENST00000462807 628 ntTSL 220.14■□□□□ 0.813e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 319.29■□□□□ 0.683e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-235ENST00000493138 694 ntTSL 319.29■□□□□ 0.683e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.553e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.323e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-213ENST00000453943 656 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.183e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-236ENST00000493209 735 ntTSL 514.83□□□□□ -0.043e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.133e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-230ENST00000485838 774 ntTSL 314□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.33e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SRPK1-201ENST00000346162 4762 ntTSL 212.8□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 512.51□□□□□ -0.413e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.422e-10■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 512.22□□□□□ -0.453e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.473e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-226ENST00000484953 273 ntTSL 211.61□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.612e-10■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-233ENST00000491613 959 ntTSL 311□□□□□ -0.653e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 510.96□□□□□ -0.653e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-207ENST00000471991 440 ntTSL 210.9□□□□□ -0.662e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 310.76□□□□□ -0.693e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 310.25□□□□□ -0.773e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 39.82□□□□□ -0.843e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SRPK1-202ENST00000361690 4286 ntTSL 1 (best)8.5□□□□□ -1.053e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.123e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 HNRNPA1-211ENST00000551665 925 ntTSL 27.31□□□□□ -1.243e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-205ENST00000468598 2835 ntTSL 1 (best)6.14□□□□□ -1.432e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SRPK1-211ENST00000510290 621 ntTSL 35.68□□□□□ -1.53e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-208ENST00000485365 693 ntTSL 25.22□□□□□ -1.572e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-203ENST00000466213 1431 ntTSL 1 (best)4.95□□□□□ -1.622e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-204ENST00000466745 662 ntTSL 24.45□□□□□ -1.72e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 HNRNPA1-214ENST00000551803 372 ntTSL 34.34□□□□□ -1.713e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-209ENST00000485454 339 ntTSL 24.04□□□□□ -1.762e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SFPQ-210ENST00000490668 434 ntTSL 23.45□□□□□ -1.862e-9■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RAB17-208ENST00000430445 421 ntTSL 510.65□□□□□ -0.75e-8■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 RPS24-208ENST00000475468 623 ntTSL 514.74□□□□□ -0.057e-14■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 CCNL1-208ENST00000466101 911 ntTSL 213.44□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.631e-6■□□□□ 8.6
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