Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SSX1Q16384 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SSX1Q16384 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SSX1Q16384 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SSX1Q16384 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SSX1Q16384 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SSX1Q16384 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SSX1Q16384 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SSX1Q16384 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX1Q16384 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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