Protein–RNA interactions for Protein: Q14687

GSE1, Genetic suppressor element 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSE1Q14687 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSE1Q14687 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSE1Q14687 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms