Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN1Q14457 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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