Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRQ13535 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRQ13535 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRQ13535 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRQ13535 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRQ13535 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRQ13535 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRQ13535 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRQ13535 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRQ13535 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRQ13535 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRQ13535 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRQ13535 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRQ13535 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRQ13535 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRQ13535 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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