Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CTBP1Q13363 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CTBP1Q13363 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CTBP1Q13363 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CTBP1Q13363 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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CTBP1Q13363 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP1Q13363 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CTBP1Q13363 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTBP1Q13363 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTBP1Q13363 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTBP1Q13363 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTBP1Q13363 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTBP1Q13363 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms