Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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