Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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TRAF2Q12933 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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TRAF2Q12933 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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TRAF2Q12933 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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TRAF2Q12933 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TRAF2Q12933 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TRAF2Q12933 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF2Q12933 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TRAF2Q12933 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TRAF2Q12933 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TRAF2Q12933 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF2Q12933 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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