Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 LINC01399-201ENST00000423311 648 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-12■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 UBAP2-208ENST00000459988 2628 ntTSL 26.1□□□□□ -1.432e-12■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 UBAP2-210ENST00000480885 4572 ntTSL 22.87□□□□□ -1.952e-12■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 AL669831.3-209ENST00000440200 413 ntTSL 54.98□□□□□ -1.614e-11■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 AL669831.3-203ENST00000419394 491 ntTSL 54.18□□□□□ -1.744e-11■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 TEAD1-204ENST00000527376 477 ntTSL 321.53■■□□□ 1.044e-8■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 ANKHD1-207ENST00000421134 4814 ntTSL 517.93■□□□□ 0.467e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.077e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.037e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.257e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.289e-7■■■■□ 21.7
ILF3Q12906 AFF1-209ENST00000511996 480 ntTSL 213.92□□□□□ -0.181e-7■■■■□ 21.6
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ILF3Q12906 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PRAME-209ENST00000439106 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.76□□□□□ -0.219e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.279e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.349e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.359e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.359e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PRAME-207ENST00000420709 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.83□□□□□ -0.369e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.479e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.489e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PRAME-213ENST00000492657 2831 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.499e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.071e-6■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.691e-6■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 DCP2-202ENST00000502635 514 ntTSL 54.35□□□□□ -1.713e-6■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 526.77■■□□□ 1.883e-6■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 FARP1-232ENST00000601009 667 ntTSL 59.2□□□□□ -0.946e-7■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.68e-7■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 315.07■□□□□ 08e-7■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 313.13□□□□□ -0.318e-7■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.561e-6■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.015e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.335e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 FHIT-204ENST00000468189 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.555e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 FHIT-206ENST00000488467 601 ntTSL 311.04□□□□□ -0.645e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 FHIT-207ENST00000490952 1720 ntTSL 1 (best)9.34□□□□□ -0.925e-8■■■■□ 21.6
ILF3Q12906 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.263e-6■■■■□ 21.5
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ILF3Q12906 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TOP3B-203ENST00000424393 824 ntTSL 510.81□□□□□ -0.683e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TOP3B-210ENST00000444502 4163 ntTSL 210.37□□□□□ -0.753e-6■■■■□ 21.5
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ILF3Q12906 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.729e-7■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 ARL15-206ENST00000510591 804 ntTSL 53.47□□□□□ -1.859e-7■■■■□ 21.5
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ILF3Q12906 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.792e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.745e-8■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 SFXN5-213ENST00000479293 1808 ntTSL 223.85■■□□□ 1.412e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 SFXN5-210ENST00000472259 1690 ntTSL 323.7■■□□□ 1.392e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.265e-8■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.262e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.112e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-208ENST00000450000 574 ntTSL 421.95■■□□□ 1.12e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-201ENST00000464782 640 ntTSL 421.37■■□□□ 1.012e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 MSANTD2-207ENST00000634413 599 ntTSL 521.31■■□□□ 12e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 IFNGR2-205ENST00000439213 906 ntTSL 521.16■□□□□ 0.982e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 MSANTD2-205ENST00000527140 775 ntTSL 321.03■□□□□ 0.962e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.942e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-209ENST00000463244 545 ntTSL 420.75■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-207ENST00000475734 578 ntTSL 520.37■□□□□ 0.852e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-216ENST00000491667 566 ntTSL 220.37■□□□□ 0.852e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 C7orf26-204ENST00000445375 675 ntTSL 519.64■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-208ENST00000476617 596 ntTSL 419.47■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-204ENST00000413232 727 ntTSL 319.14■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 KDM5A-210ENST00000544760 2338 ntTSL 218.48■□□□□ 0.551e-11■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 IFNGR2-206ENST00000545369 966 ntTSL 518.38■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-221ENST00000495095 575 ntTSL 417.94■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.435e-8■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PCMTD1-205ENST00000521046 856 ntTSL 217.65■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 TFDP2-219ENST00000494358 578 ntTSL 1 (best)17.42■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 C1orf226-201ENST00000420220 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.41■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AL512785.2-201ENST00000431696 541 ntAPPRIS P1 TSL 416.99■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 LIN28B-202ENST00000635857 912 ntTSL 516.94■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CPSF7-225ENST00000545934 565 ntTSL 416.66■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 RASSF3-201ENST00000283172 1099 ntTSL 216.07■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 GNB1-206ENST00000471354 1512 ntTSL 515.2■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 C7orf26-203ENST00000440409 458 ntTSL 314.87□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 21.5
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