Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCB1Q12824 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMARCB1Q12824 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCB1Q12824 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
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