Protein–RNA interactions for Protein: Q12765

SCRN1, Secernin-1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN1Q12765 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCRN1Q12765 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCRN1Q12765 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCRN1Q12765 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCRN1Q12765 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCRN1Q12765 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCRN1Q12765 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCRN1Q12765 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCRN1Q12765 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCRN1Q12765 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCRN1Q12765 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCRN1Q12765 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCRN1Q12765 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCRN1Q12765 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCRN1Q12765 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCRN1Q12765 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCRN1Q12765 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCRN1Q12765 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCRN1Q12765 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCRN1Q12765 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCRN1Q12765 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCRN1Q12765 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCRN1Q12765 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCRN1Q12765 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCRN1Q12765 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCRN1Q12765 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms