Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 YDL199CYDL199C 2064 nt4.69□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 TRM11YOL124C 1302 nt4.69□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 PUB1YNL016W 1362 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 PAN1YIR006C 4443 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 THI20YOL055C 1656 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 RPL34AYER056C-A 366 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 ACF4YJR083C 930 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 VPH2YKL119C 648 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YAR047CYAR047C 321 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 VPS63YLR261C 327 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 SAP30YMR263W 606 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 GRE2YOL151W 1029 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YBR012CYBR012C 420 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YPL107WYPL107W 747 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 NHP6AYPR052C 282 nt4.68□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 RDH54YBR073W 2877 nt4.67□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 SSB1YDL229W 1842 nt4.67□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 SSB2YNL209W 1842 nt4.67□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 OPT2YPR194C 2634 nt4.67□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YGR039WYGR039W 312 nt4.67□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YJR011CYJR011C 786 nt4.67□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 RPL15BYMR121C 615 nt4.67□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YBL071CYBL071C 309 nt4.67□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt4.67□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 AXL2YIL140W 2472 nt4.67□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 PEX29YDR479C 1665 nt4.67□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 SEC2YNL272C 2280 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YGR117CYGR117C 1431 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YCR064CYCR064C 411 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YER046W-AYER046W-A 330 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 GET1YGL020C 708 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 EMC2YJR088C 879 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 OAR1YKL055C 837 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YKT6YKL196C 603 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 MDG1YNL173C 1101 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 TPK2YPL203W 1143 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 MRPS9YBR146W 837 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 DER1YBR201W 636 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 TUB3YML124C 1338 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 TRM44YPL030W 1704 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 GDE1YPL110C 3672 nt4.66□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 HOT1YMR172W 2160 nt4.65□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 RNT1YMR239C 1416 nt4.65□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 LAS21YJL062W 2493 nt4.65□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 TIF4632YGL049C 2745 nt4.65□□□□□ -1.66
MCD1Q12158 RSM24YDR175C 960 nt4.65□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YDR269CYDR269C 324 nt4.65□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YIR020CYIR020C 303 nt4.65□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 APS1YLR170C 471 nt4.65□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 IDP2YLR174W 1239 nt4.65□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 CAT5YOR125C 702 nt4.65□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 MNT4YNR059W 1743 nt4.65□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 UBP6YFR010W 1500 nt4.65□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 RSC58YLR033W 1509 nt4.65□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 RPN3YER021W 1572 nt4.65□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 KAR2YJL034W 2049 nt4.65□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 FAR8YMR029C 1572 nt4.65□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 MDR1YGR100W 2853 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YAP1802YGR241C 1707 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 snR68snR68 136 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YER079WYER079W 633 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 MRM2YGL136C 963 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 RPI1YIL119C 1224 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YKE2YLR200W 345 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 NNT1YLR285W 786 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YML003WYML003W 873 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 MRPL39YML009C 213 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 SVS1YPL163C 783 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 PDR5YOR153W 4536 nt4.64□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YER077CYER077C 2067 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 KRE6YPR159W 2163 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 ECL1YGR146C 636 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 MTM1YGR257C 1101 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 DPH1YIL103W 1278 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 IES3YLR052W 753 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YPR050CYPR050C 414 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YPR174CYPR174C 666 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 MNT2YGL257C 1677 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 PGM2YMR105C 1710 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YOL153CYOL153C 1746 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 SUP35YDR172W 2058 nt4.63□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 SIN4YNL236W 2925 nt4.62□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 ALO1YML086C 1581 nt4.62□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt4.62□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YGL039WYGL039W 1047 nt4.62□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 VMA10YHR039C-A 345 nt4.62□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 TPM2YIL138C 486 nt4.62□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 ENT3YJR125C 1227 nt4.62□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 RPS4AYJR145C 786 nt4.62□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 YNL181WYNL181W 1224 nt4.62□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 HUB1YNR032C-A 222 nt4.62□□□□□ -1.67
MCD1Q12158 RCL1YOL010W 1104 nt4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22 ms