Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD300CQ08708 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms