Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL9Q07325 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms