Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABPB1Q06547 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms