Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDR2Q01850 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms