Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF9Q00978 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms