Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2C1P98194 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms