Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX1P83916 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX1P83916 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX1P83916 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX1P83916 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX1P83916 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX1P83916 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX1P83916 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX1P83916 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX1P83916 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX1P83916 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX1P83916 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX1P83916 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX1P83916 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX1P83916 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX1P83916 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX1P83916 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX1P83916 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX1P83916 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX1P83916 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX1P83916 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX1P83916 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX1P83916 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX1P83916 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX1P83916 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX1P83916 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX1P83916 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX1P83916 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX1P83916 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX1P83916 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX1P83916 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX1P83916 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX1P83916 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX1P83916 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX1P83916 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX1P83916 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX1P83916 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms