Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM193AP78312 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM193AP78312 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms