Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00315P59091 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00315P59091 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms