Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELLP55199 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELLP55199 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELLP55199 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELLP55199 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ELLP55199 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELLP55199 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELLP55199 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELLP55199 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELLP55199 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELLP55199 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELLP55199 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELLP55199 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELLP55199 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELLP55199 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELLP55199 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ELLP55199 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ELLP55199 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELLP55199 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELLP55199 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELLP55199 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELLP55199 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELLP55199 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ELLP55199 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms