Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A2P52657 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms