Protein–RNA interactions for Protein: P49821

NDUFV1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV1P49821 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDUFV1P49821 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFV1P49821 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms