Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTDSS1P48651 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms