Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNJ1P48048 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNJ1P48048 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNJ1P48048 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNJ1P48048 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNJ1P48048 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNJ1P48048 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNJ1P48048 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNJ1P48048 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNJ1P48048 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNJ1P48048 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms