Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARL1P40616 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARL1P40616 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARL1P40616 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARL1P40616 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARL1P40616 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARL1P40616 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ARL1P40616 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL1P40616 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL1P40616 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL1P40616 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL1P40616 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL1P40616 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL1P40616 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL1P40616 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL1P40616 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL1P40616 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL1P40616 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL1P40616 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARL1P40616 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARL1P40616 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARL1P40616 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ARL1P40616 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARL1P40616 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARL1P40616 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ARL1P40616 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARL1P40616 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARL1P40616 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL1P40616 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARL1P40616 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARL1P40616 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARL1P40616 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARL1P40616 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARL1P40616 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ARL1P40616 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ARL1P40616 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARL1P40616 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARL1P40616 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL1P40616 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL1P40616 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARL1P40616 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARL1P40616 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARL1P40616 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARL1P40616 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARL1P40616 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARL1P40616 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARL1P40616 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARL1P40616 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARL1P40616 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARL1P40616 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARL1P40616 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARL1P40616 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARL1P40616 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms