Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOX11P35716 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOX11P35716 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOX11P35716 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SOX11P35716 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOX11P35716 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX11P35716 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX11P35716 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX11P35716 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX11P35716 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX11P35716 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX11P35716 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX11P35716 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX11P35716 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms