Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN2P35609 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms