Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5DP30049 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5DP30049 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms