Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMOD1P29536 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD1P29536 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms