Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB4P28070 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms