Protein–RNA interactions for Protein: P26447

S100A4, Protein S100-A4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A4P26447 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
S100A4P26447 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
S100A4P26447 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
S100A4P26447 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
S100A4P26447 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
S100A4P26447 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms