Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFKBIAP25963 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFKBIAP25963 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFKBIAP25963 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NFKBIAP25963 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKBIAP25963 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKBIAP25963 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKBIAP25963 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms