Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms