Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DESP17661 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DESP17661 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DESP17661 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DESP17661 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DESP17661 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DESP17661 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DESP17661 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DESP17661 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DESP17661 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DESP17661 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DESP17661 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DESP17661 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DESP17661 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DESP17661 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DESP17661 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DESP17661 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DESP17661 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DESP17661 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DESP17661 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DESP17661 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DESP17661 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DESP17661 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DESP17661 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DESP17661 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DESP17661 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DESP17661 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DESP17661 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DESP17661 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DESP17661 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DESP17661 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DESP17661 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DESP17661 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DESP17661 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DESP17661 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DESP17661 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DESP17661 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DESP17661 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DESP17661 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms