Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSPT1P15170 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSPT1P15170 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSPT1P15170 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSPT1P15170 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSPT1P15170 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms