Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC192P0DO97 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms