Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CGB3P0DN86 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CGB3P0DN86 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms