Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOA1P02647 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOA1P02647 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOA1P02647 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOA1P02647 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOA1P02647 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOA1P02647 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOA1P02647 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms