Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB6O95452 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB6O95452 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB6O95452 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB6O95452 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB6O95452 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB6O95452 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB6O95452 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB6O95452 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB6O95452 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB6O95452 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB6O95452 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB6O95452 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB6O95452 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB6O95452 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB6O95452 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB6O95452 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB6O95452 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB6O95452 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms