Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRATO95237 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRATO95237 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRATO95237 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRATO95237 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRATO95237 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRATO95237 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRATO95237 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRATO95237 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRATO95237 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRATO95237 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRATO95237 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms