Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF3JO75822 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3JO75822 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms