Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSO75390 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSO75390 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSO75390 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSO75390 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSO75390 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSO75390 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSO75390 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSO75390 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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